*XyMTeX [#j669bd8c]
一般に化学の学術雑誌への投稿には，化学者専用の化学構造描画パッケージとして
[[ChemDraw:http://www.chem-station.com/yukitopics/chemdraw.htm]]，
またはアカデミックユーザーのみ無料で使用可能であり登録する必要もない
[[ISIS/Draw:http://www.chem-station.com/yukitopics/3dmethod2.htm]]
などのソフトを利用することが化学者の間では常識であります。

欧米および日本において一流の化学の学術雑誌では TeX での原稿を受け付けて
いない現状を見ますと，数学・物理での状況とは大きく異なっているようです。

実際に化学雑誌の場合では
ごく限られた物となりますが，TeX による原稿でも受理可能な雑誌等への投稿の折
には[[藤田眞作さん:http://xymtex.com/fujitas/]]@[[湘南情報数理化学研究所:http://xymtex.com/]]の
[[XyMTeX （キュムテフ）:http://xymtex.com/fujitas3/xymtex/]]が
参考になることでしょう。

なお，簡単な参照ページとして
「[[LaTeX で化学構造式 — XyMTeX の紹介:http://www.klavis.info/xym.html]]」
「[[LaTeX で化学構造式 — XyMTeX の紹介（Internet Archive のウェブアーカイブ）:http://web.archive.org/web/20090224162250/http://www.klavis.info/xym.html]]」
および
「[[PukiWiki XyMTeX プラグイン（Internet Archive のウェブアーカイブ）:http://web.archive.org/web/20060113004208/http://tec-tech.org/?PukiWiki/Plugin/xymtex.inc.php]]」
を挙げておきます。

XyMTeX は改良に改良を重ね，（試して
いませんが）[[マイトトキシン (maitotoxin)>WikiPedia.ja:マイトトキシン]]
#ref(http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f1/Maitotoxin.png/654px-Maitotoxin.png,center,nolink,マイトトキシンの構造式)
のような複雑な化合物でも TeX やパッケージの仕様などの制限さえなければ
理論的に描画可能なレベルまでになりました。

現時点で描画の難しい構造として，いす型構造式において環の融合や ATOMLIST 指定が
不可であること，任意の平面構造より立体的に突出した構造（楔形のことではない。
これは Version 4.01 で実装済み）を描く際に picture 環境などによる
レイアウト指定が必要になることを挙げます。例えばフグ毒である
次の[[テトロドトキシン (tetrodotoxin)>WikiPedia.ja:テトロドトキシン]]
#ref(http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5a/Tetrodotoxin-2D-skeletal.png/275px-Tetrodotoxin-2D-skeletal.png,center,nolink,テトロドトキシンの構造式)
を XyMTeX で描画する際には，おそらく一から picture 環境などで描画する必要が
あります（いす型構造式において ATOMLIST として N を指定しなければならないので
chair 命令が使えない）。これらを描画する際には相変わらず
ChemDraw，ISIS/Draw などの WYSIWYG ソフトが必要になるかもしれません。