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*XyMTeX [#j669bd8c]
XyMTeX は[[藤田眞作さん:http://xymtex.com/fujitas/]]@[[湘南情報数理化学研究所:http://xymtex.com/]]による化学構造式を描画するマクロ集です.~
TeX Live, W32TeX に含まれています.~
-[[湘南情報数理化学研究所 xymtex.com:http://xymtex.com/]]
--[[XyMTeX 化学構造式描画:http://xymtex.com/fujitas3/xymtex/]]
-http://www.ctan.org/pkg/xymtex
簡単な参照ページとして
「[[LaTeX で化学構造式 — XyMTeX の紹介(Internet Archive のウェブアーカイブ):http://web.archive.org/web/20090224162250/http://www.klavis.info/xym.html]]」
および
「[[PukiWiki XyMTeX プラグイン(Internet Archive のウェブアーカイブ):http://web.archive.org/web/20060113004208/http://tec-tech.org/?PukiWiki/Plugin/xymtex.inc.php]]」
を挙げておきます。
XyMTeX は改良に改良を重ね,(試して
いませんが)[[マイトトキシン (maitotoxin)>Wikipedia.ja:マイトトキシン]]
XyMTeX は改良に改良を重ね,(試していませんが)
[[マイトトキシン (maitotoxin)>Wikipedia.ja:マイトトキシン]]
#ref(http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f1/Maitotoxin.png/654px-Maitotoxin.png,center,nolink,マイトトキシンの構造式)
のような複雑な化合物でも TeX やパッケージの仕様などの制限さえなければ
理論的に描画可能なレベルまでになりました。
のような複雑な化合物でも TeX やパッケージの仕様などの制限さえなければ理論的に描画可能なレベルまでになりました。
現時点で描画の難しい構造として,いす型構造式において環の融合や ATOMLIST 指定が
不可であること,任意の平面構造より立体的に突出した構造(楔形のことではない。
これは Version 4.01 で実装済み)を描く際に picture 環境などによる
レイアウト指定が必要になることを挙げます。例えばフグ毒である
次の[[テトロドトキシン (tetrodotoxin)>Wikipedia.ja:テトロドトキシン]]
現時点で描画の難しい構造として,
- いす型構造式において環の融合や ATOMLIST 指定が不可であること
- 任意の平面構造より立体的に突出した構造(楔形のことではない。これは Version 4.01 で実装済み)を描く際に picture 環境などによるレイアウト指定が必要になること
を挙げます。
例えばフグ毒である次の[[テトロドトキシン (tetrodotoxin)>Wikipedia.ja:テトロドトキシン]]
#ref(http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5a/Tetrodotoxin-2D-skeletal.png/275px-Tetrodotoxin-2D-skeletal.png,center,nolink,テトロドトキシンの構造式)
を XyMTeX で描画する際には,おそらく一から picture 環境などで描画する必要が
あります(いす型構造式において ATOMLIST として N を指定しなければならないので
chair 命令が使えない)。これらを描画する際には相変わらず
ChemDraw,ISIS/Draw などの WYSIWYG ソフトが必要になるかもしれません。
を XyMTeX で描画する際には,おそらく一から picture 環境などで描画する必要があります
(いす型構造式において ATOMLIST として N を指定しなければならないので chair 命令が使えない)。~
これらを描画する際には相変わらず ChemDraw,Marvin Sketch などの WYSIWYG ソフトが必要になるかもしれません。~
これについては [[TeX と化学]] を参照してください。
*関連リンク [#d1c64818]
-[[LaTeX - XyMTeX 美構造式作成入門:http://qiita.com/TeX-seminar/items/c11f8b364d6391737b20]]
-[[MacTeX で XyMTeX:http://www.clas.kitasato-u.ac.jp/~fujiwara/MacTeX/xymtex.html]]